Universidades paulistas criam plataforma gratuita para análise de dados genéticos sem necessidade de programação

Pesquisadores da Unicamp, USP e Unesp desenvolveram o CellForgeR, a primeira plataforma brasileira voltada para a análise de dados genéticos complexos que dispensa a necessidade de conhecimentos em programação. A ferramenta, disponibilizada gratuitamente via internet, permite que cientistas investiguem informações de células individuais de forma acessível.

O software opera com dados provenientes do single-cell RNA-seq (sequenciamento de RNA de célula única). Enquanto métodos tradicionais analisam o material genético de tecidos de forma conjunta, essa tecnologia identifica a atividade gênica de cada célula separadamente.

Democratização da bioinformática

A principal inovação do CellForgeR é a eliminação de barreiras técnicas e de infraestrutura. Anteriormente, a interpretação desses dados exigia computadores de alta performance e domínio avançado de bioinformática. Agora, a seleção de genes, parâmetros e tipos celulares é feita por meio de menus e botões, sem a escrita de códigos.

A plataforma é hospedada no Cluster Científico do Instituto de Biologia da Unicamp, o que significa que o usuário não precisa instalar softwares em sua máquina, acessando recursos de processamento especializado diretamente pelo navegador. Segundo Marcelo Mori, professor da Unicamp, processos que demandavam diversas etapas de programação e hardware potente agora são concluídos em minutos.

Aplicações em saúde e pesquisa

A ferramenta amplia a capacidade de investigação em diversas áreas da ciência:

• Oncologia: Possibilita a seleção de células do sistema imunológico em tumores para identificar a atividade de genes específicos e compará-los com outras células.
• Doenças Metabólicas: Permite o exame de células ligadas à obesidade e ao metabolismo.
• Biologia Celular: Facilita a observação de diversidades biológicas em células que antes eram agrupadas em categorias reduzidas, auxiliando na compreensão do funcionamento de patologias.

É importante ressaltar que o CellForgeR não substitui exames médicos nem realiza diagnósticos automáticos; sua finalidade é estritamente a interpretação de grandes volumes de dados científicos por pesquisadores.

Desenvolvimento e acesso

O projeto foi idealizado por especialistas em bioinformática das três universidades paulistas. A iniciativa teve como motivação a experiência de Diogo de Moraes, pesquisador da Unesp, que utilizou ferramentas similares durante seu doutorado na Harvard Medical School, nos Estados Unidos, com apoio da FAPESP. O objetivo foi criar uma alternativa nacional que reduzisse a dependência de infraestrutura computacional própria e softwares estrangeiros.

Para fomentar o uso da tecnologia, a equipe planeja oferecer treinamentos a pesquisadores interessados na análise de células únicas. O acesso à plataforma já está disponível gratuitamente através do endereço oficial do CellForgeR.